培训班

2019年10月19日-21日
成都 • 星宸航都国际酒店

蛋白质、代谢组培训班
(明鉴厅 2层)

日期 课程
19日 基于质谱的检测技术与项目流程
代谢组、蛋白组在科学研究中的应用
多组学文章发表中高级图表解读
代谢组学数据分析、挖掘及与转录组联合分析(以文章为主线)
1、分析流程解读
2、单变量统计分析
3、多变量统计分析
4、关联分析
5、显著差异代谢物个性化分析
20日 上午 蛋白组学数据分析、挖掘及与转录组联合分析(以文章为主线)
1、分析流程解读
2、分组分析
3、差异分析,功能注释
4、差异蛋白的个性化分析
20日下午-21日 R语言绘图--绘制代谢、蛋白文章经典图形
1、表达量聚类热图
2、样品相关性热图
3、OPLS-DA分析
4、 CCA 分析
5、相关性网络图
6、功能注释分类图
7、注释富集图
8、富集弦图

基因组及群体研究培训班
(明志厅 2层)

日期 课程主题
19日 基因组研究技术发展及研究思路、文献分享
群体+GWAS研究技术发展及研究思路、文献分享
基因组大数据挖掘-根据NG,science实例文章进行解读
Linux基础 1、Linux系统介绍
2、Linux常用基本命令
3、3Linux文件系统
20日
circos软件安装,使用 linux,windows安装说明
circos图的应用实例和结果解读 circos图能做什么,说明什么
circos图的绘图步骤 1、子配置文件的讲解
2、主配置文件的讲解
3、数据准备和结果导入
4、绘图数据展示类型
21日 系统进化树构建的方法 1、系统进化树构建的生物学意义
2、系统进化树的分类
3、数据准备
4、系统进化树的构建的方法,包括RaxML,phyML,MEGA
5、进化树美化:MEGA,ITOL
系统进化树分化时间的估算方法 MCMCtree软件的使用
发放结业证书

转录组常用个性化分析及数据挖掘培训班
(宸藻厅 2层)

日期 课程
19日 R语言基础 1、数据类型与结构
2、分支与循环
3、函数
Heatmap分析 1、热图多元化应用介绍;
2heatmap实操;
3、重现文章经典heatmap
4、不同热图软件比较;
PCA分析 1PCA原理及应用介绍;
2PCA降维实操;
3、文章中PCA图片重现;
4、其他降维方法比较;
K-means聚类分析 1、聚类方法原理介绍
2、聚类软件使用
3、结果讲解
SOM聚类分析 1、聚类方法原理介绍
2、聚类软件使用
3、结果讲解
20日 GSEA基因富集分析 1GSEA方法介绍及其应用;
2GSEA工具步骤拆解及结果解读;
3GSEA数据准备;
4GSEA实操;
IGV基因组数据可视化分析 1、软件简介
2、数据可视化操作
3、常用数据可视化应用
WGCNA共表达分析 1WGCNA背景介绍及应用讲解
2WGCNA数据过滤
3、基因之间相关系数计算
4、基因模块的确定
5、模块与性状相关联
6、网络构建
7、绘制经典WGCNA
21日 多组学联合分析 1、多组学联合分析的思路介绍
2、多组学联合分析的实例介绍
3、几种组学联合分析方法详解
靶基因分析 1、靶标预测方法及原理讲解
2、分析软件介绍
3、构建调控网络
ceRNA分析 1ceRNA原理讲解
2、分析方法介绍
3、构建ceRNA网络
Cytoscape网络数据可视化 1、软件简介及安装
2、构建调控网络
3、筛选子网络
4、节点及边的属性操作
总结 拓展、结业总结、发放结业证书

注意事项

关于注册

1、培训班为选购门票。
2、培训班不接受单独报名,需与大会门票一同注册缴费。
3、培训费:2000元/人(含午餐,晚餐自理,原价3500元)
4、培训班咨询:guoyy@biomarker.com.cn
关于课程

参加“蛋白代谢组”、“转录组”培训班的老师,请务必自带电脑(电脑配置不限,windows版和mac均可),并提前安装相关软件,安装包及安装指南请前往大会现场QQ群文件中下载,软件包中有windows版和mac版,可以根据电脑情况下载安装。
大会现场QQ群号:658754807